تفاوت بین منابع اطلاعاتی پروتئین (PIR) و بازگشت داده های پروتئین (PDB) چیست؟


پاسخ 1:

PDB: Protein Data Bank (PDB) یک پایگاه داده برای داده های ساختاری سه بعدی مولکول های بیولوژیکی بزرگ مانند پروتئین ها و اسیدهای نوکلئیک است. این داده ها ، که به طور معمول توسط کریستالوگرافی با اشعه X ، طیف سنجی NMR یا میکروسکوپ الکترونیکی فزاینده کریو الکترون بدست می آید و توسط بیولوژیست ها و بیوشیمیست ها از سراسر جهان منتقل می شود ، از طریق وب سایت های سازمان های عضو آن بطور رایگان قابل دسترسی است.

برخی وب سایتهای مهم عبارتند از:

www.wwpdb.org

www.pdbe.org

www.rcsb.org/pdb

www.bmrb.wisc.edu

www.pdbj.org

PIR: منابع اطلاعاتی پروتئین (PIR) یک منبع عمومی یکپارچه برای انفورماتیک پروتئین است که از تحقیقات ژنومی و پروتئومیک و کشف علمی پشتیبانی می کند. PIR بانک اطلاعاتی توالی پروتئین (PSD) ، یک پایگاه داده پروتئین حاشیه نویسی را با بیش از 283،000 توالی که کل منطقه طبقه بندی را پوشش می دهد ، حفظ می کند.


پاسخ 2:

منبع اطلاعات پروتئین (PIR) یک منبع بیوفورماتیک عمومی یکپارچه است که از تحقیقات و کشف های علمی ژنومی و پروتئومیک پشتیبانی می کند (وو و همکاران 2003). PIR در سال 1984 توسط بنیاد ملی تحقیقات زیست پزشکی (NBRF) تأسیس شد. PIR در مرکز پزشکی دانشگاه جورج تاون ، ایالات متحده واقع شده است.

اهداف اصلی PIR هستند

  1. ایجاد یک بانک اطلاعاتی پروتئینی سازمان یافته ، غیرمشکل ، جامع برای مطالعه روابط ساختاری ، کاربردی و تکاملی به منظور تولید اطلاعات در مورد منشأ بیولوژیکی توالی های پروتئینی ، به گونه ای که این پایگاه داده به راحتی در حوزه عمومی قابل دسترسی باشد و مراجعات متقابل را با سایر پایگاه های داده امکان نمایش اطلاعات ساختاری زیست مولکول ها فراهم کند. باشد

Protein Data Bank (PDB) یک پایگاه داده با داده های ساختاری سه بعدی از مولکول های بزرگی مانند پروتئین و اسیدهای نوکلئیک است. PDB در سال 1971 در طبیعت جدید زیست شناسی به عنوان سرمایه گذاری مشترک بین مرکز داده کریستالوگرافی کمبریج ، انگلیس ، و آزمایشگاه ملی بروکهاون ایالات متحده اعلام شد. در سال 2003 این سازمان به یک سازمان بین المللی مبنی بر نظارت بر پایگاه داده پروتئین در سراسر جهان PDB تبدیل شد.

PDB حاوی نام پروتئین ، گونه ها ، تعیین ساختار ، توالی اسید آمینه و سایر اطلاعات است. ماموریت این است که یک بایگانی واحد از بانک اطلاعاتی پروتئین با داده های ساختاری ماکرومولکولی حفظ کند. داده ها توسط بیولوژیست ها و بیوشیمیست ها از سراسر جهان بطور رایگان از طریق وب سایت های سازمان های عضو خود و بصورت هفتگی به روز در دسترس اینترنت قرار می گیرد.

Ref:

  • ویکی پدیا مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی www.wwpdb.org